Paint.net sollte eigentlich ein kostenloser Ersatz für das beliebte Microsoft Paint sein. Es hat sich jedoch zu einem leistungsfähigen Design-Tool entwickelt, da es neue und erweiterte Funktionen wie mehrere Ebenen, Spezialeffekte oder Farbverläufe erhalten hat.

Das Tool bietet ähnliche Funktionen wie die beliebtesten Grafikdesign-Tools, z. B. Adobe Photoshop und GIMP. Paint.net bietet außerdem eine übersichtliche und intuitive Benutzeroberfläche, mit der sich auch Neulinge schnell zurechtfinden.